作为马拉巴海岸的霸主，卡利卡特的印度人本身，并非不想允许葡萄牙人在此贸易，毕竟每笔交易，都会为自己带来税收。
然而，阿拉伯商人在卡利卡特的渗透太深了，他们深知，如果，葡萄牙人成为了，卡利卡特的新合作伙伴，自己将可能被边缘化。
为了阻止双方达成协议，卡利卡特的阿拉伯人，甚至在达伽马离开之后，就暗杀了其留在城内的几名，充当联络人的葡萄牙水手。
并威胁以罢市的方式，阻止卡利卡特的统治者，与葡萄牙人达成协议。
当葡萄牙人的船队再次来临，并准备在卡利卡特扫货时，阿拉伯人很快对这个竞争对手，发动了袭击。
不甘示弱的葡萄牙人，也同样用武力做出了反应。
这次短暂冲突，对双方都造成了一定损失，并且让葡萄牙人，暂时放弃了与卡利卡特贸易的想法。
好在，卡利卡特并不是马拉巴海岸，唯一的贸易港口，虽然是最强的。
相比卡利卡特的敌对态度，以柯钦为代表的其它马拉巴城邦，对葡萄牙人的态度，就要缓和的多了。
毕竟，葡萄牙人代表着，一个巨大的新市场。
因此，未能进入卡利卡特的葡萄牙船队，在柯钦等港口，还是收购到了足够的货物，并于次年中，回到葡萄牙。
尽管，因为风暴和武装冲突，损失了半数船只，葡萄牙人的这次航行，依旧带来的丰厚的利润。
只不过，对于葡萄牙来说，卡布拉尔船队的，这次印度之旅的意义，决不在于又一次证明了，航路的可行以及印度的富庶。
而在于，让葡萄牙人意识到，他们虽然可以，在阿拉伯诸商业集团内部，寻找到贸易对象。
但要想吃到最大的那块蛋糕，战争将是唯一的方式。
为了达到这个目标，在印度寻找基地，并驻扎一支常备海军，即印度洋舰队，被提上了议事日程。
鉴于印度距离葡萄牙本土，是如此的遥远，并且，对手并非弱小的土着部落。
葡萄牙建立印度洋舰队的想法，在当时不可谓不疯狂。
不过，东方贸易所带来的巨大利润，足以让葡萄牙上下，去接受这个挑战。
公元1502年2月，经过充分的准备之后，达伽马再次受命远洋印度。
与前两次不同的是，达伽马这次，不再是以使者和商人的身份，出访印度，
而带着“印度洋海军上将”的尊号，以及由20艘军舰（武装商船），组成的舰队前往印度。
如果，前两次印度之旅，葡萄牙人的原则，是尽量避免冲突，力图通过和平的方式，达成贸易合作。
那么，这次的话，他们则完全做好了，“仗剑行商”的准备。
在东非斯瓦希里城邦，达伽马代表葡萄牙，第一次向阿拉伯人，展示出了称霸印度洋的决心。
迫于葡萄牙船队的压力，以及自己的体量，大型斯瓦希里城邦的常住居民不过万人。
因此，基尔瓦的绿教统治者，表示愿意臣服于葡萄牙。
对于东非的阿拉伯人来说，这样做也有可能是一次机会。
最起码从表面看起来，葡萄牙人能够帮助他们对接欧洲市场。
而在此之前，输入往地中海的海上商品，只会经由波斯湾或者红海。
事实上，葡萄牙人对东非的想法，远不止于将既有的斯瓦希里城邦，纳入自己的贸易网那么简单。
能够在印度洋获得成功，决定着葡萄牙，能不能晋升为一个“帝国”。
在印度洋，印度才是成败的关键。
为此，在达伽马第二次启航前往印度之后，葡萄牙人紧接着，就派出了优秀的军官团，前往印度，准备迎接，接下来的挑战。
以职业军人取得航海家，成为船队乃至海外领地的主官，也成为了葡萄牙从商业扩张，向武力扩张的转折点。
然而，在马拉巴海岸，已经跟印度土着政权，形成共生关系的阿拉伯商业集团，
尤其是霸主卡利卡特所能够调动的资源，要远高于斯瓦希里城邦。
当达伽马以同样的态度，要求卡利卡的统治者顺从时，与印度统治者，关系良好的阿拉伯商业集团，作出了激烈的反应。
拥有强大武力的达伽马，则开始打劫，他们所遇到的阿拉伯商船，以期迫使阿拉伯人屈服。
在这个过程中，达伽马舰队中的数艘军舰，与卡利卡特海军，实际为阿拉伯武装商船，在卡利卡特附近的海域，进行了两次海战。
尽管卡利卡特的船只，在数量上十倍于葡萄牙人，但与有备而来的葡萄牙军舰相比，战力明显不足，最终完败于葡萄牙人。
这一结果，使得马拉巴海岸的印度城邦，尤其是卡利卡特最大的竞争对手柯钦，纷纷开始与葡萄牙人合作。
虽然在冲突失败之后，卡利卡特也表示，愿意与葡萄牙人就贸易问题，做进一步协商，但双方实际都不认为，和平就此到来。
尤其葡萄牙人还要求卡利卡特，驱逐所有的阿拉伯人。
相比之下，柯钦的态度就要“真诚”的多。
对于征服者来说，利用被征服地区的内部矛盾，能够让他们事半功倍的完成目标。
比如，在以后的美洲征服中，大家就会常态性的看到，总会有某支土着部落，
愿意充当“带路党”，以借助白人的力量，来打击自己的对手。
柯钦所拿出的最大诚意，就是在达伽马的船队返航之后，允许其留驻印度的分舰队，驻扎于自己的港口。
葡萄牙随后向柯钦派驻军事人员，也用实际行动，表明自己的存在，对柯钦提升在马拉马海岸的竞争力，
包括稳定内政都有诸多好处，显然，柯钦的阿拉伯人，不会喜欢看到这种合作。
在葡萄牙人“帮助”镇压，阿拉伯人所引发的叛乱之后，柯钦的统治者，甚至同意葡萄牙人，
在自己的海岸线上，构筑军事据点（公元1503年）。
对于在印度洋拥有野心的葡萄牙来说，这点至关重要。